无菌室的洁净度一般从100级~100,000级，灌装间也叫无菌室，洁净度等级可以参照《洁净度等级参照表》，饮料工厂的无菌室设计洁净度级别一般在1,000级~10,000级之间，填充包装车间严格控制在100级，原料调配车间，加工及杀菌区可以设计为100,000级；无菌室内要保持正压状态，排气量较机组进气量少25%左右，无菌室与普通车间的压差要求在200pa左右，不同等级的无菌室互相之间要求在67pa左右；
无菌室采用的洁净式送风机组应包含制冷、初效过滤段、中效过滤段、风机段、增压段等；冷量和新风经由经过保温措施的风管送入洁净无菌室区域，末端采用HEPA高效无隔板过滤器过滤系统，HEPA对0.3um以上的空气尘埃粒子的过滤效率达99.995%以上，HEPA除过病菌外，空气中所有的微生物几乎可以全部过滤掉以达到绝对的无菌效果；
无菌室的物料入口需要设置净化装置，如货淋室、风淋通道等标准风淋门设备；
无菌室的人员入口需要按照QS标准安装风淋门，风淋门风速要求达23M/S以上，以达到除尘效果；